(1)整洁：微生物操作区是各种病原菌相对集中的地方，洁净室，为了减少粉尘流动，防止交叉污染，操作区应与外界分开。实验室工作人员进入操作区应换鞋，送标本人员不进入操作区，操作区地面用专用拖把每天拖1次，每天早上工作前，用紫外线照射30min，或每天工作后，用紫外线照射60min，对整个操作区进行消毒;下午工作结束后用消毒液消毒工作台面，东营洁净室，以保证工作环境的安全清洁。(2)光线：细菌培养的细小菌落试验凝集颗粒的观察， 都需要有充足的光线。操作区除设置常规照明灯外，还必须安装操作台灯，以保证实验结果的正确判断。(3)通风：由于各种病原菌集中，空气污浊，实验室要求保持排的生物安全柜中进行。(4)温度和湿度：由于无菌操作的要求，实验过程中经常使用酒精灯，因此，微生物学实验室不能安装吊扇。为了达到实验所需的适宜温度，洁净室施工及验收规范，尤其：满足某些仪器对温度湿度的要求，实验室应安装空调。(5)电源：要求提供稳压、恒频的电源;根据仪器设备要求，必要时配备不间断电源。(6)水源：操作区内须设置水源。用于标本处理(如，细菌染色) 的水槽与工作人员洗手用的水槽不能混用。(7)污染物处理：操作区须备有消毒缸，以处理沾有活菌的玻片等污染物品。检验剩余的标本及使用过的带菌平板、试管均须集中地点安全放置，经消毒灭菌处理后再洗涤或丢弃。
食品洁净工程常被应用于食品原材料加工、深加工的生产中。采用的净化技术，将空气中的微粒子、有害气体等污染物严格控制。同时达到无菌包装效果，这里指在洁净的环境中完成对食品的包装工艺。另外，对食品发酵也起到了一定作用。食品净化工程净化车间要求要满足生产时的送风量，快速有效的排除室内污染。
当然，为了更有效的保证车间内洁净度，在建设洁净工程车间时是有讲究的。一般情况下，墙、顶的材料采用彩钢板；门窗采用氧化铝型材；地面采用环氧自流坪，要有防静电效果。
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